COVID-19疫情成就
2021年 體系榮獲第四屆全球永續獎（GCSA）「疫情貢獻獎」暨第十四屆台灣企業永續獎（TCSA）「報告書白金獎」。
2021年 因應COVID-19疫情，成立台灣第一間微負壓產房。
2020年 於COVID-19疫情期間，因採檢量全台第一，榮獲蔡英文總統頒發全國防疫獎章。
2020年 因應COVID-19疫情，成立台灣第一間負壓手術室。
國際學者成就
2022年 魏福全院士榮獲「澳洲國際醫療照護標準委員會（Australian Council on Healthcare Standard International, ACHSi）國際獎章」，表彰對提升國際醫療照護服務品質與安全具有傑出貢獻。
2022年 魏福全院士榮獲美國整形外科醫師協會（American Association of Plastic Surgeons, AAPS）成立百年首次設立「創新研究成就獎（Research Achievement Award for Innovation）」之首位得獎人，藉以表彰其於臨床研究之傑出成就。
2020年 幹細胞與轉譯癌症研究所陳鈴津特聘講座教授/中研院院士榮獲「2020美國ASCO兒科腫瘤獎與獎座（Pediatric Oncology Award and Lecture）」。
2019年 魏福全院士榮獲「2018-2019年總統科學獎」。
2019年 陳肇隆名譽院長榮獲「國際肝臟移植醫學會2019終身成就獎」。
2018年 馮思中教授、謝森永教授榮獲「2018 AACR Team Science Award」團隊研究奬。
2018年 莊垂慶教授榮獲美國顯微重建外科醫學會最高榮譽獎。
2017年 魏福全教授所編著書籍「Flaps and Reconstructive Surgery」，榮獲BMA Medical Awards 2017年外科類第一名。
2015年 陳肇隆教授獲頒中美洲議會Francisco Morazan指揮官級勳章。
2015年 陳肇隆教授獲頒巴拉圭衛生貢獻獎章。
2015年 陳肇隆教授、鄭汝汾醫師獲頒瓜地馬拉衛生貢獻獎章。
2014年 魏福全教授榮膺世界頭頸部癌症學會遴選為該領域百年來最具貢獻的二十位學者第三名。
2014年 魏福全教授榮膺美國整形外科學會及美國東南整形外科學會，遴選為全世界最具創新發明的十大整形外科醫師第三名。
2014年 魏福全教授榮獲美國ACAPS學術理事會及SESPRS學會評選為「當代最具影響力的十大整形外科醫師之一」。
2013年 廖運範院士，因 36 年來所領導的長庚肝臟研究中心團隊對慢性B型肝炎的自然病史、相關的免疫致病機轉及其治療做出相當重要的貢獻，榮獲「歐洲肝臟研究學會」肯定，獲頒「歐洲肝臟學會終身成就獎」。
2013年 郭和昌醫師榮獲美國過敏免疫學院（AAAAI）之國際年輕研究學者獎。
2010年 蔡銘鴻醫師名列Marquis世界名人錄(Marquis Who's Who in the World 2009~2010)。
2009年 廖美南博士、陳敏夫教授、陳訓徹副教授等榮獲美國癌症護理期刊「傑出研究論文獎」。
2007年 陳肇隆教授為亞洲肝臟移植手術之先驅，在活體肝臟移植居國際領先地位，對增進全民健康、提升國際醫療水準有卓越貢獻，獲選為中國工程院醫藥衛生學部2007年新院士，成為中國工程院1994年成立以來，台灣第二位獲選院士。
2008年 為全球唯一醫療機構擁有三位美國整形外科醫學會Maliniac Lecturer榮譽得主（1994羅慧夫教授、2001魏福全教授、2008陳昱瑞教授）。
2006年 鄭明輝教授榮獲美國顯微重建外科醫學會Godina Lecturer獎，為全亞洲第一個得到此殊榮的醫師。
2006年 魏福全教授榮獲美國頒發「世界整形手術創新獎」，被遴選為世界近代整形外科史上20名重大創新貢獻醫師之一。
2004年 陳昱瑞教授榮獲美國顎顏外科學會特殊榮譽獎。
2003年 魏福全教授榮獲美國整形外科醫學會「2003 Maliniac Lecturer」榮譽。
2000年 廖運範教授在肝癌方面傑出成就，榮獲第二十三屆中央研究院生物組院士。
1994年 羅慧夫教授榮獲美國整形外科醫學會「1994 Maliniac Lecturer」榮譽。
長庚成就
2021年 胸腔外科團隊成立台灣第一所、全球第二所「影像導引式胸腔鏡手術示範中心」。
2021年 高雄長庚紀念醫院質子中心建築，榮獲2021年世界不動產聯盟全球卓越建設獎-特定目的興建類銀獎，為當年度該類別台灣唯一獲獎者。
2020年 成為台灣第一所「長庚機器人手術訓練中心」 (達文西手術訓練中心)。
2019年 林口長庚紀念醫院成為全國第一家通過HIMSS EMRAM 第7級（最高等級）國際認證之醫療機構。
2018年 成立高雄長庚紀念醫院永慶質子治療中心，為台灣最新型也是第二台質子放射治療設備。
2015年 林口長庚紀念醫院尖端醫療園區質子暨放射治療中心開幕啟用，為台灣第一座、亞洲最大的質子放射治療中心。
2014年 以全球最大單一量體3,700床醫學中心級之醫院規模，通過「國際醫療品質（Joint Commission International, JCI）認證」（學術型醫學中心，AMC），JCI總部總裁並親自蒞臨本院頒予認證證書。
2012年獲選為全球最優活體肝臟移植中心，舉辦國際學習營，由Novartis資助亞洲及美洲各國醫師接受訓練。
2007年 引進達文西機械手臂手術系統，並派遣多位醫師出國學習該項系統的操作與運用，將傳統外科手術帶入一個微創與科技結合的全新紀元。
1997年 行政院衛生署核准林口兒童醫院獨立，成為台灣首創之兒童醫院。
1986年 首創台灣醫院先看診後繳費制度。